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188宝金博页面版: 利用mtDNA COI基因序列分析引进的澳洲虫纹鳕鲈群体遗传多样性

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内容提示: 第26 卷第2期水产学杂志V 01. 26, N o . 220 13年4 月C H I N E S EJO U R N A LO FF IS H E R IE S= 一= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = =文章编号: 10 0 5—38 32( 20 13)0 2—0 0 14 - 0 5A pr. 2叭三一利用m tD N AC O /基因序列分析引进的澳洲虫纹鳕鲈群体遗传多样性张龙岗, 杨玲, 李娴, 孟庆磊, 朱永安( 山东省淡水水产研究所, 山东省淡水水产遗传育种重点实验室, 山东济南250 117 )摘要: 根据线粒体C 0 1基因序列分析了虫纹鳕鲈( M o ccu llo ch eU ap ee兢)引进群体的遗传多样性。 用P C R 技术扩增了线粒体C 0 1的序列, P C R 产物经纯化、 克隆和测序后得到了6 52b p 的核苷酸片段。 运用C L U S T A LX ( 1. 8 3)软件比对了25个个体的序列, 共检测到5个多态位点, 其中4 个为转换位点, 1个为颠...

文档格式:PDF | 页数:5 | 浏览次数:276 | 上传日期:2015-03-26 23:05:26 | 文档星级:
第26 卷第2期水产学杂志V 01. 26, N o . 220 13年4 月C H I N E S EJO U R N A LO FF IS H E R IE S= 一= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = =文章编号: 10 0 5—38 32( 20 13)0 2—0 0 14 - 0 5A pr. 2叭三一利用m tD N AC O /基因序列分析引进的澳洲虫纹鳕鲈群体遗传多样性张龙岗, 杨玲, 李娴, 孟庆磊, 朱永安( 山东省淡水水产研究所, 山东省淡水水产遗传育种重点实验室, 山东济南250 117 )摘要: 根据线粒体C 0 1基因序列分析了虫纹鳕鲈( M o ccu llo ch eU ap ee兢)引进群体的遗传多样性。 用P C R 技术扩增了线粒体C 0 1的序列, P C R 产物经纯化、 克隆和测序后得到了6 52b p 的核苷酸片段。 运用C L U S T A LX ( 1. 8 3)软件比对了25个个体的序列, 共检测到5个多态位点, 其中4 个为转换位点, 1个为颠换位点; 运用M E G A 5. 0软件构建了N J系统树; 用D N A S P 软件计算出的单倍型个数( 日)为5, 单倍型多样性( 删)为0. 300, 核苷酸多样性( A )和平均核苷酸差异数( 壳)为分别为O . 0 0 0 7 3和0 . 4 7 3。 结果表明, 引进群体的虫纹鳕鲈m tD N AC 0 1基因序列的变异程度较。 群体内遗传多样性较低。关键词: 虫纹鳕鲈; m tD N A ; C 0 1; 遗传多样性中图分类号: Q 17 3文献标识码: AG e n e ticD iv e r sityo fIn tr o d u c e dM u r r a yC o d ( M a ccu llo ch ellap eelii)P o p u la tio nB a se d o nm t c o lG e n eZ H A N GL o n g —g a n g , Y A N GL in g , L I X ia n , M E N GQ in g —lei, Z H UY o n g - a n( S h a n d o n gP r o v in c ia l K e yL a b f o rG e n e tic s& B r e e d in ginF r e sh w a te rF ish e r ie s. F r e sh w a te r F ish e r ie s R e se a r c hIn stitu te o fS h a n d o n gP r o v in c e , Jin a n2 50 117 , C h in a )A b str a c t: T h eg e n e tic d iv er sityo fm u r r a yc o d ( M a c c u llo c h e llap eelii)in tr o d u cedf o r mA u str a liaw a s stu d ie db ym t C O lg e n ese -q u e n c e stoe x p lo r eth eg e n e ticstr u c tu r e o fth e f ish . T h e m t D N AC 0 1g e n ew a sa m p lif ie din 2 5 in d iv id u a lsb yP C Rw h o sep r o d u c tsw e r ep u r if ie d , c lo n e da n dse q u e n c e d . T h e 6 52 b pn u c le o tid ese q u e n c e so f p a r tia lC 0 1g e n ew e r ef o u n d , a n dth ese q u e n c e so f th ese sa m —p ie sw e r ec o m p a r e db yC L U S T A LX ( 1. 8 3)e a c ho th er . F iv e v a r ia tio n sites w e r e o b se r v e din c lu d in g4 tr a n sitio n sites a n d 1 tr a n sv e r -sio n site. T h e N Jp h y lo g e n e tictr e e sw e r ec o n str u c te db yM E G A5. 0 so f tw a re. A s e stim a te db yD N A S P , th eh a p lo ty p e s( H )w a sf o u n dto b e 5 inn u m b e r , th e h a p lo ty p e d iv ersity ( 日d )0 . 30 0 , th en u c le o tid ed iv ersity ( 只)0. 0007 3a n dth ea v e r a g en u m b e ro f n u c le o tid e d if -f e r e n c e s( k )0 . 4 7 3. It c a r l b e c o n c lu d e dth a t th e m t C O lg e n eo f th e in tr o d u c e dM a ccu llo ch ellap eelii p o p u la tio nh a sr ela tiv elylo wlev elo f v a r ia tio n a n dp o o ring e n e tic d iversity.K e yw o r d s: M a ccu llo ch ellap e e le ; m ito c h o n d r ia l D N A ; C 0 1; g e n e tic d iv er sity虫纹鳕鲈( M a ccu llo ch ellap eelii)隶属于硬骨鱼纲( O steich th y es), 鲈形目( P ercrm es), 肖鲈科( R r—cich th y id o e), 鳕鲈属( M a ccu llo ch ella ), 原产于澳大利亚东南部墨瑞一达令河流域。 虫纹鳕鲈肉质嫩白, 细腻而结实, 肌间刺很少, 外型特殊, 口感鲜美,在澳大利亚素有“国宝鱼” 美称。 此鱼为世界上最大淡水鱼之一, 生长速度很快、 环境适应力强, 繁殖力旺盛, 商品价值很高, 目前我国已引进养殖, 但是国内有关虫纹鳕鲈的资料较少, 仅见其生物学特性及驯化养殖的报道…], 对引进的虫纹鳕鲈群体遗传特性目前尚未见报道。鱼类线粒体D N A ( m tD N A )与其他脊椎动物线粒体一样, 都是共价闭合的双链分子。 其结构简单、进化速度快、 几乎不发生重组、 呈严格的母系遗传并且突变固定后形成的多态位点可反映出群体的遗传结构, 已成为探讨种群遗传结构、 种内遗传分收稿日期: 2012—09 —04基金项目: 农业部“9 4 8” 项目( 2011- z4 1).作者简介: 张龙岗( 19 82一), 男, 山东济宁人。 硕士, 助理研究员, 从事水产动物遗传育种研究. E —m a il: zig 一0302@ 163. to m通信作者: 朱永安, 研究员, 从事淡水水产动物引育种研究. E ~m a il: zh u y o n g a n l9 65@ 163. co m万方数据

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