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188宝金博页面版: 生物信息学数据库

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内容提示: 数据库是生物信息学的主要内容, 各种数据库几乎覆盖了生命科学的各个领域。 核酸序列数据库有 GenBank, EMBL, DDBJ 等, 蛋白质序列数据库有 SWISS-PROT, PIR, OWL, NRL3D, TrEMBL 等, 蛋白质片段数据库有 PROSITE, BLOCKS, PRINTS 等, 三维结构数据库有 PDB, NDB, BioMagResBank, CCSD 等, 与蛋白质结构有关的数据库还有SCOP, CATH, FSSP, 3D-ALI, DSSP 等, 与基因组有关的数据库还有ESTdb, OMIM, GDB, GSDB 等, 文献数据库有 Medline, Uncover 等。另外一些公司还开发了商业数据库,如 MDL 等。 生物信息学数据库覆盖面广, 分布分散且格式不统一, 因此一些...

文档格式:DOC | 页数:16 | 浏览次数:26 | 上传日期:2011-10-09 09:10:30 | 文档星级:
数据库是生物信息学的主要内容, 各种数据库几乎覆盖了生命科学的各个领域。 核酸序列数据库有 GenBank, EMBL, DDBJ 等, 蛋白质序列数据库有 SWISS-PROT, PIR, OWL, NRL3D, TrEMBL 等, 蛋白质片段数据库有 PROSITE, BLOCKS, PRINTS 等, 三维结构数据库有 PDB, NDB, BioMagResBank, CCSD 等, 与蛋白质结构有关的数据库还有SCOP, CATH, FSSP, 3D-ALI, DSSP 等, 与基因组有关的数据库还有ESTdb, OMIM, GDB, GSDB 等, 文献数据库有 Medline, Uncover 等。另外一些公司还开发了商业数据库,如 MDL 等。 生物信息学数据库覆盖面广, 分布分散且格式不统一, 因此一些生物计算中心将多个数据库整合在一起提供综合服务, 如 EBI的 SRS(Sequence Retrieval System)包含了核酸序列库、 蛋白质序列库, 三维结构库等 30 多个数据库及CLUSTALW、 PROSITESEARCH 等强有力的搜索工具, 用户可以进行多个数据库的多种查询。 基因和基因组数据库 1. Genbank Genbank 库包含了所有已知的核酸序列和蛋白质序列, 以及与它们相关的文献著作和生物学注释。 它是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)建立和维护的。 它的数据直接来源于测序工作者提交的序列;由测序中心提交的大量 EST 序列和其它测序数据; 以及与其它数据

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