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188宝金博页面版: 蛋白质结构预测的优化模型与方法Ξ

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内容提示: 生物信息学辞典   DNA微阵列或芯片( DNA microarray or chip) 技术 是近年发展起来的又一新的分子生物学研究工具, 利用光导化学合成、 照相平板印刷以及固相表面化学合成等技术,在固相表面合成成千上万个寡核苷酸探针, 或将液相合成的探针由微阵列器或机器人点样于尼龙膜或硅片上, 再与放射性同位素或荧光物标记的DNA或cDNA杂交,用于分析DNA突变及多态性、 DNA测序、 监测同一组织细胞在不同状态下或同一状态下多种组织细胞基因表达水平的差异、 发现新的致病基因或疾病相关基因等多个研究领域. 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism , 缩...

文档格式:PDF | 页数:15 | 浏览次数:6 | 上传日期:2015-03-19 13:48:24 | 文档星级:
生物信息学辞典   DNA微阵列或芯片( DNA microarray or chip) 技术 是近年发展起来的又一新的分子生物学研究工具, 利用光导化学合成、 照相平板印刷以及固相表面化学合成等技术,在固相表面合成成千上万个寡核苷酸探针, 或将液相合成的探针由微阵列器或机器人点样于尼龙膜或硅片上, 再与放射性同位素或荧光物标记的DNA或cDNA杂交,用于分析DNA突变及多态性、 DNA测序、 监测同一组织细胞在不同状态下或同一状态下多种组织细胞基因表达水平的差异、 发现新的致病基因或疾病相关基因等多个研究领域. 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism , 缩写SNP) 技术 由于同一位点的不同等位基因之间常常只有一个或几个核苷酸的差异, 因此在分子水平上对单个核苷酸的差异进行检测是很有意义的。 目前SNP作为一种新的分子标记, 已有2000多个标记定位于人类染色体上, 在植物上也在进行开发研究。 可在胶上也可不在胶上就能检测出SNP, 但检测SNP的最佳方法是新近发展起来的DNA芯片技术 。特定序列位点 即sequence-tagged site,缩写STS, 是对由其特定引物序列所界定的一类标记的统称。 这类分子标记包括: (1 ) STMS(Sequence-tagged microsatellites)通常又称为SSR, 也可称为SSRP(Simple Sequence Repeat Polymorphisms); (2)加锚微卫星寡核苷酸(Anchored microsatellite oligonucleotides); (3) SCAR(Sequence-characterized amplified regions); (4) CAPS (Cleaved amplified polymorphic sequence); (5) SPAR (single primer amplification reaction); (6) DAMD(directed amplification of minisatellite region DNA); (7) Inter-Alu PCR like genomic profiling; (8) ISTR(inverse sequence-tagged repeat); (9) IFLP (intron fragment length polymorphism); (10) RAMPO(random amplified microsatellite polymorphism) 限制性片段长度多态性 即restriction fragment length polymorphism技术,缩写RFLP, 是发展最早的分子标记技术。 RFLP技术的原理是检测DNA在限制性内切酶酶切后形成的特定DNA片段的大小。因此凡是可以引起酶切位点变异的突变如点突变(新产生和去除酶切位点)和一段DNA的重新组织(如插入和缺失造成酶切位点间的长度发生变化)等均可导致RFLP的产生。 此技术及其从中发展起来的一些变型均包括以下基本步骤: DNA的提取、 用限制性内切酶酶切DNA、 用凝胶电泳分开DNA片段、 把DNA片段转移到滤膜上、 利用放射性标记的探针显示特定的DNA片段(通过Southern杂交)和分析结果。 由于线粒

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