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    188宝金博页面版: P311蛋白与金属硫蛋白ⅡA相互作用位点的计算机预测 Computer Prediction of P311 Protein and Metallothionein Ⅱ A Protein Interactio

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    内容提示： 第１７ 卷第６ 期２０ １１年１２月上海戈亨ｆ 报（ 自然科学版）ＪＯ Ｕ Ｒ Ｎ Ａ ＬＯ ＦＳ Ｈ Ａ Ｎ Ｇ Ｈ Ａ ＩＵ Ｎ ＩＶ Ｅ Ｒ Ｓ ＩＴ Ｙ （ Ｎ Ａ Ｔ Ｕ Ｒ Ａ ＬＳ Ｃ Ｉ Ｅ Ｎ Ｃ Ｅ ） Ｄ ｅ ｃ ．ｖ 。 １． １７ Ｎ 。 ． ６２ ０ １１ｄ ｏ ｉ： １０． ３９６９／ｊ． ｉｓｓｎ． １００７－ ２８６１． ２０ｌ１． ０ ６ ． ０ ０ ８Ｐ ３１１蛋白与金属硫蛋白Ⅱ Ａ相互作用位点的计算机预测薛晓怡，冯铁男，王群群，王翼飞（ 上海大学理学院， 上海２０ ０ ４ ４ ４ ）摘要： Ｐ ３１ｌ蛋白广泛表达于多种组织， 并参与体内细胞分化、 调节其他蛋白／基因转录、 创伤修复、 肿瘤发生等多种正常或异常的生物学活动． 研究发现， 金属硫蛋白Ⅱ Ａ （ ｍ ｅｔａ ｔｌｏ ｔｈ ｉｏ ｎ ｅｉｎ １ＩＡ ， Ｍ Ｔ ２Ａ ）参与Ｐ ３１ｌ基因的表达， 并起着关键性的调节作用， 这说明二者存在着相互作用的关系． 采用同源建模的方法构建Ｐ ３１ｌ蛋白的３Ｄ 结构， 使用Ａ ｕ ｔｏ ｄ ｏ ｃｋ ４ ． ０ 软件将结构模型与Ｍ Ｔ ２Ａ 进行分子对接， 模拟蛋白...

    文档格式：PDF | 页数：6 | 浏览次数：22 | 上传日期：2015-04-14 00:33:07 | 文档星级：
    第１７ 卷第６ 期２０ １１年１２月上海戈亨ｆ 报（ 自然科学版）ＪＯ Ｕ Ｒ Ｎ Ａ ＬＯ ＦＳ Ｈ Ａ Ｎ Ｇ Ｈ Ａ ＩＵ Ｎ ＩＶ Ｅ Ｒ Ｓ ＩＴ Ｙ （ Ｎ Ａ Ｔ Ｕ Ｒ Ａ ＬＳ Ｃ Ｉ Ｅ Ｎ Ｃ Ｅ ） Ｄ ｅ ｃ ．ｖ 。 １． １７ Ｎ 。 ． ６２ ０ １１ｄ ｏ ｉ： １０． ３９６９／ｊ． ｉｓｓｎ． １００７－ ２８６１． ２０ｌ１． ０ ６ ． ０ ０ ８Ｐ ３１１蛋白与金属硫蛋白Ⅱ Ａ相互作用位点的计算机预测薛晓怡，冯铁男，王群群，王翼飞（ 上海大学理学院， 上海２０ ０ ４ ４ ４ ）摘要： Ｐ ３１ｌ蛋白广泛表达于多种组织， 并参与体内细胞分化、 调节其他蛋白／基因转录、 创伤修复、 肿瘤发生等多种正常或异常的生物学活动． 研究发现， 金属硫蛋白Ⅱ Ａ （ ｍ ｅｔａ ｔｌｏ ｔｈ ｉｏ ｎ ｅｉｎ １ＩＡ ， Ｍ Ｔ ２Ａ ）参与Ｐ ３１ｌ基因的表达， 并起着关键性的调节作用， 这说明二者存在着相互作用的关系． 采用同源建模的方法构建Ｐ ３１ｌ蛋白的３Ｄ 结构， 使用Ａ ｕ ｔｏ ｄ ｏ ｃｋ ４ ． ０ 软件将结构模型与Ｍ Ｔ ２Ａ 进行分子对接， 模拟蛋白质问的相互作用， 预测二者的作用区域， 找出可能的关键残基Ｇ Ｌ Ｕ ｌ４ ， Ｓ Ｅ Ｒ ４ ８ 以及Ｇ Ｌ Ｕ ５６ ， 为进一步的实验研究奠定基。丶： Ｐ ３１１蛋白； 金属硫蛋白Ⅱ Ａ ； 同源建模； 分子对接中图分类号： Ｑ８ １文献标志码： Ａ文章编号： Ｈ Ｘ ）７ － ２８ ６１（ ２０ １１）０ ６４ ）７ ２８ － ０ ６Ｃ ｏ ｍ ｐ ｕ ｔｅ ｒＰ ｒ ｅ ｄ ｉｃ ｔｉｏ ｎ ｏ ｆ Ｐ ３ １１ Ｐ ｒ ｏ ｔｅ ｉｎａ ｎ ｄＭ ｅｔａ ｌｌｏ ｔｈ ｉｏ ｎ ｅｉｎ ｆｌ Ａ Ｐ ｒ ｏ ｔｅ ｉｎＩｎ ｔｅ ｒ ａ ｃ ｔｉｏ ｎ Ｓ ｉｔｅｓＸ Ｕ ＥＸ ｉａ ｏ —ｙ ｉ，Ｆ Ｅ Ｎ ＧＴ ｉｅ－ ｎ ａ ｎ ，Ｗ Ａ Ｎ ＧＱ ｕ ａ － ｑ ｕ ｎ ，Ｗ Ａ Ｎ ＧＹ ｉ—ｆ ｅｉ（ Ｃ ｏ Ｈ ｅｇ ｅｏ ｆＳ ｃ ｉｅ ｎ ｃ ｅ ｓ， Ｓ ｈ ａ ｎ ｇ ｈ ａ ｉ Ｕ ｎ ｉｖ ｅ ｒ ｓｉｔｙ ， Ｓ ｈ ａ ｎ ｇ ｈ ａ ｉ ２０ ０ ４ ４ ４ ， Ｃ ｈ ｉｎ ａ ）Ａ ｂ ｓｔｒ ａ ｃ ｔ： Ｐ ３１ １ ｗ ａ ｓ ｉｄ ｅｎ ｔｉｆ ｉｅｄｂ ｙ ｓｕ ｐ ｐ ｒ ｅ ｓｓｉｖ ｅｓｕ ｂ ｔｒ ａ ｃｔｉｏ ｎｈ ｙ ｂ ｒ ｉｄ ｉｚ ａ ｔｉｏ ｎｆ ｉｔ８ｐ ｏ ｔｅｎ ｔｉａ ｌｌｙｉｎ ｖ ｏ ｌｖ ｅ ｄ ｉｎ ｓｍ ｏ ｏ ｔｈｍ ｕ ｓｃ ｌｅｍ ｙ ｏ ｇ ｅ ｎ ｅ ｓｉｓ． Ｔ ｈ ｅＰ ３１ １ｅ ｘ ｐ ｒ ｅ ｓｓｉｏ ｎｉｓｒ ｅ ｇ ｕ ｌａ ｔｅ ｄａ ｔｍ ｕ ｌｔｉｐ ｌｅｌｅｖ ｅｌｓｂ ｙ ｐ ａ ｔｈ ｗ ａ ｙ ｓｔｈ ａ ｔ ｃｏ ｎ ｔｒ ｏ ｌｃｅｌｌｕ ｌａ ｒｔｒ ａ ｎ ｓｆ ｏ ｒ ｍ ａ ｔｉｏ ｎ ． Ｉｔ ｈ ａ ｓ ｂ ｅ ｅ ｎ ｄ ｅ ｍ ｏ ｎ ｓｔｒ ａ ｔｅ ｄ ｉｎ ｔｈ ｅ ｌｉｔｅｒａ ｔｕ ｒｅ ｔｈ ａ ｔ ｍ ｅ ｔａ ｌｌｏ ｔｈ ｉｏ ｎ ｅ ｉｎ ｌＩＡ （ Ｍ Ｔ ２ Ａ ）ｉ８ａ ｓｓｏ ｃｉａ ｔｅ ｄ稍ｔｈ ｔｈ ｅｅ ｘ ｐ ｒ ｅ ｓｓｉｏ ｎｏ ｆ Ｐ ３１１， ａ ｎ ｄｉｔ ｉＳ ｃｒｉｔｉｃａ ｌ ｉｎ ｔｈ ｅｒｅｇ ｕ ｌａ ｔｉｏ ｎ ． Ｔ ｈ ｅｒｅｆ ｏ ｒｅ， ｉｔｈ ａ ｓ ｂ ｅ ｅ ｎ ｃ ｏ ｎ ｓｉｄ ｅ ｒ ｅ ｄ ｔｈ ａ ｔｉｎ ｔｅｒ ａ ｃｔｉｏ ｎ ｂ ｅ ｔｗ ｅ ｅ ｎ Ｐ ３１１ ａ ｎ ｄ Ｍ Ｔ ２ Ａ ｅ ｘ ｉｓｔｓ． Ａ３Ｄｍ ｏ ｄ ｅ ｌ ｏ ｆ Ｐ ３ １ １ｐ ｒ ｏ ｔｅ ｉｎ ｂ ｙ ｈ ｏ ｍ ｏ ｌｏ ｇ ｙ ｍ ｏ ｄ ｅｌｉｎ ｇｉｓｃｏ ｎ ｓｔｒｕ ｃｔｅｄ ， ａ ｎ ｄｔｈ ｅ ｒ ｅｌａ ｔｅｄ ｒ ｅ ｓｉｄ ｕ ｅ ｓ ｆ ｏ ｒ ｉｎ ｔｅｒ ａ ｃｔｉｏ ｎ ａ ｌｅａ ｎ ａ ｌｙ ｚ ｅ ｄｗ ｉｔｈ Ａ ｕ ｔｏ ｄ ｏ ｃ ｋ４． ０． Ｔ ｈ ｅ ｒｅｓｕ ｌｔｓ ｓｈ ｏ ｗｔｈ ａ ｔ ａ ｍ ｉｎ ｏａ ｃ ｉｄ ｓ ｓｕ ｃ ｈ ａ ｓＧ Ｌ Ｕ ｌ４ ， Ｓ Ｅ Ｒ ４ ８ａ ｎ ｄＧ Ｌ Ｕ ５ ６ ａ ｒ ｅｉｍ ｐ ｏ ｒ ｔａ ｎ ｔｉｎｂ ｉｎ ｄ ｉｎ ｇ ， ｗ ｈ ｉｃ ｈｆ ｏ ｒ ｍ ｓ ａ ｂ ａ ｓｉｓ ｆ ｏ ｒｆ ｕ ｒ ｔｈ ｅｒｅ ｘ ｐ ｅ ｒ ｉｍ ｅ ｎ ｔｓ．Ｋ ｅ ｙｗ ｏ ｒ ｄ ｓ： Ｐ ３１ １ｐ ｒ ｏ ｔｅ ｉｎ ； ｍ ｅ ｔａ ｌｌｏ ｔｈ ｉｏ ｎ ｅ ｉｎｌＩＡ （ Ｍ Ｔ ２Ａ ）ｐ ｒ ｏ ｔｅ ｉｎ ； ｈ ｏ ｍ ｏ ｌｏ ｇ ｙ ｍ ｏ ｄ ｅ ｌｉｎ ｇ ； ｄ ｏ ｃ ｋ ｉｎ ｇＰ ３１１是一种具有重要生物学作用的细胞因子，它参与体内细胞分化、 调节其他蛋８ ／基因转录、 创伤修复、 肿瘤发生等多种正常或异常的生物学活动旧３． 已有的研究结果显示， Ｐ ３１１在抗纤维化、 瘢收稿日期： ２０１０－ ０４ － ２３基金项目： 国家自然科学基金资助项目（ ３０ ８ ７ １３４ １）； 上海市重点学科建设资助项目（ ￥ ３０ １０ ４ ）； 上海市教委重点学科建设资助项目（ ＪＳ ０ １０ １）通信作者： 王翼飞（ １９ ４ ８ 一）， 男， 教授， 博士生导师， 研究方向为计算分子生物学． Ｅ － ｍ ａ ｉｌ： ｙ 如ｉ Ｍ ｎ ｇ ＠ ｓｔａ ｆ ｆ ． ｓｈ ｕ ． ｅｄ ｕ ． ｃｎ万方数据

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