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188宝金博页面版: 原位杂交探针的制备

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内容提示: 原位杂交探针制备步骤 1. 转录模板的选。貉∪∧康幕蛑150-1200bp 长短的无ployA尾巴的非保守区段为模板。如果模板长度大于 500bp, 杂交前需要将探针进行温和碱水解,小于 500bp 探针杂交前则可不进行碱解。 2. 转录模板的制备:因为转录模板的纯度直接影响着探针合成的质量和数量,所以一般用质粒纯化试剂盒提取质粒。 首先,将模板 DNA 片断连接到 pGEM-T easy 克隆载体上, 转化大肠杆菌,经酶切或 PCR 鉴定甚至测序以后,挑取目的克。0遄詈梦聪蛄,将来用 T7 转录酶合成 anti-sense探针,用 SP6 转录酶合成 sense 探针。模板正向连接时用 SP6 转录酶合成 ...

文档格式:DOCX | 页数:4 | 浏览次数:50 | 上传日期:2024-05-28 17:51:17 | 文档星级:
原位杂交探针制备步骤 1. 转录模板的选。貉∪∧康幕蛑150-1200bp 长短的无ployA尾巴的非保守区段为模板。如果模板长度大于 500bp, 杂交前需要将探针进行温和碱水解,小于 500bp 探针杂交前则可不进行碱解。 2. 转录模板的制备:因为转录模板的纯度直接影响着探针合成的质量和数量,所以一般用质粒纯化试剂盒提取质粒。 首先,将模板 DNA 片断连接到 pGEM-T easy 克隆载体上, 转化大肠杆菌,经酶切或 PCR 鉴定甚至测序以后,挑取目的克。0遄詈梦聪蛄,将来用 T7 转录酶合成 anti-sense探针,用 SP6 转录酶合成 sense 探针。模板正向连接时用 SP6 转录酶合成 anti-sense 探针,用 T7 转录酶合成 sense 探针)于 30ml LB 液体培养基(含 50mg/l Amp) 中 37℃, 200rpm 过夜(约 16 小时)。待菌液浓度约为 5.0 A600 U/ml 时可以提取质粒。 3. 转录模板线性化: 先取少量的质粒溶液,用载体上的合适的多克隆位点的限制性内切酶进行酶切。限制性内切酶切断后必须为 5'突出或平端, 严禁采用 3'突出的限制性内切酶(如实在只能用 3'突出的限制性内切酶,则可在酶切后用T4 DNA聚合酶或大肠杆菌DNA聚合酶Klenow片段在4种dNTP存在下消除 3'突出端)。 转录模板中应没有同样的酶切位点。载体上只有一个酶切位点。可用的限制性内切酶只有 NcoI、SpeI、NdeI。酶切后,电泳检测,如果酶切结果正常,就可以大量酶切模板。一般选用 100-150 l 酶切体系。 4. 转录模板的纯化 将四管酶切产物合并一起(1.5ml 离心管),(从此时起一直到杂交结束,要进行严格的RNA 操作)用 DEPC•H2O 将总体积补到为 600-700 l。 ① 加入等体积的苯酚,漩涡振荡器充分震荡混匀 ,12000 rpm 离心 5 min。取水相; ② 再加入等体积氯仿(RNA 用),漩涡振荡器充分震荡混匀 ,12000rpm 离心 5 min,取水相;(在此实验操作中,氯仿的主要作用是抽提苯酚)重复 1次氯仿抽提 。将水相转移到新的离心管中。( 注意:小心取上部水相,体积约占水相总体积的 2/3 即可,勿贪下部水相可能含有痕量的苯酚——RNA 聚合酶的强烈抑制剂,它的存在将严重降低转录效率甚至导致转录失败。实验表明,氯仿抽提时充分震荡混匀和最后的吸取水相的操作是探针合成中最关键的步骤 )

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